哈利波特魔法觉醒中除了主线剧情和决斗俱乐部，还有很多有趣的课程可以体验。这些课程不仅还原了原著中的经典魔法课堂，还加入了独特的玩法机制。每天系统会根据课表轮换开放两种课程，每种课程都有不同的挑战目标和评分标准，完成课程能获得学院分、课堂学分以及各种道具奖励。课程玩法分为单人教学关和多人协作模式，多人课堂需要三名小伙伴组队参与，配合默契才能拿到高分。
黑魔法防御课是游戏中极具挑战性的课程之一，主要内容包括对付衣柜里的博格特、应对摄魂怪以及制服康沃尔郡小精灵。面对博格特和摄魂怪这类BOSS战时，建议携带纽特回响搭配召唤生物卡组，注意保持召唤物分散站位避免被范围攻击清场。康沃尔郡小精灵关卡需要快速清理不断刷新的小精灵，使用澳洲蛋白眼幼龙、火螃蟹等具有范围攻击能力的卡牌效果更佳。合理搭配卡珊德拉、丹尼尔等伙伴卡能提供稳定的输出和续航能力。
神奇动物保护课主要分为地精保卫战和鹰头马身兽驯服两个部分。在地精关卡中需要保护南瓜不被成群结队的地精破坏，推荐使用火螃蟹、烟花盒等具有持续输出能力的驻场卡，配合毒液、闪电风暴等解场法术。鹰头马身兽关卡更注重单体输出，可以沿用黑魔法防御课的卡组配置。特别要注意的是在鹰头马身兽课程中，卡珊德拉容易因为不鞠躬而受到重创，需要及时使用白鲜香精等治疗卡保护她。
魔咒课包含开锁咒和漂浮咒两种特色玩法。开锁咒是3v3对抗模式，需要与NPC争夺中间柜子的控制权，携带充气咒、速速禁锢等控制类卡牌能有效打断对方开锁进度。漂浮咒关卡要合力击败巨怪，队友之间沟通使用连续漂浮咒可以触发伤害加成，记得携带嗅嗅保证魔力恢复。占卜课则是轻松有趣的你画我猜玩法，考验小伙伴们的默契和想象力，系统会根据绘画还原度给予评分。
魔法史课程是原著党的福音，采用答题竞赛的形式考查大家对哈利波特系列知识的了解。题目涵盖魔法生物、重要事件、人物关系等各个方面，答对越快得分越高，连续答对还能获得额外加分。这个课程不需要复杂操作，但需要丰富的原著知识储备，最终成绩以小队总分计算。课堂积分可以用来兑换魔药配方和素材，每天上限200分，积极参与中午的学院活动能快速攒满积分。
除了常规课程外，游戏还会不定期推出特色主题活动，比如古代如尼文课、魔药配制课等。这些特殊课程往往带有新颖的玩法机制和丰厚的奖励，记得关注游戏公告及时参与。上课时注意查看每个关卡的三星条件，有些成就需要特定操作才能达成，合理安排卡组和战术才能完美通关所有挑战。
