舰队编组是无尽的拉格朗日中的核心玩法之一，合理的编组能显著提升战斗效率。首先需要明确舰队指挥值的分配，单支舰队最多可容纳300指挥值，升级到九级基地并解锁相关建筑后可提升至400。舰船在舰队中的位置分为前排、中排和后排，系统会根据舰船蓝图中的定位自动分配站位，无法手动调整。敌方舰船会优先攻击前排，因此防御型舰船应尽量安排在前排吸收伤害。编组时需注意舰船类型与站位的匹配性，例如装甲型驱逐舰适合前排，而输出型巡洋舰更适合中后排。舰队命名不仅便于管理，还能在PVP中起到迷惑对手的作用。
舰船加点和技术值分配是优化舰队性能的关键环节。不同类型的舰船需要针对性加点，例如装甲型舰船优先提升护甲和生命值，侦察型舰船则需强化动力系统。技术值可通过战斗或蓝图研究获取，用于解锁舰船的强化选项。输出型舰船应优先提升火力与命中率，而支援型舰船则需注重冷却缩减和锁定效率。部分舰船拥有特殊策略技能，如低血量时触发闪避加成，这类技能往往能扭转战局。技术值分配需权衡短期战力与长期发展，避免过度集中于单一属性。
舰队搭配需综合考虑火力、防御、防空和载机能力。完整的舰队应包含五种定位的舰船：输出、防御、修复、防空和载机。根据敌方舰载机数量动态调整防空舰船比例，舰载机较少时可减少防空单位。战巡和航母指挥值消耗较高，建议通过增援功能加入舰队以避免占用基础指挥值。增援时需注意曲速航行会转为普通航行，因此不要在曲速状态下进行增援操作。舰队移动速度取决于最慢的舰船，编组时需平衡速度与战斗力。
采矿与资源管理是维持舰队运转的基础。工程船可与运输舰混编提升采集效率，前期建议采用1:1:3的比例分配金属、重氢和晶体采集。采矿平台能节省计划圈并提供10%-30%的采集加成，但仅限同盟成员使用。远距离作业时可先派遣高速侦察舰建立计划圈，再增援工程船以利用曲速移动缩短航行时间。资源连接仅对基地生效，通过前哨站连接矿点后迁移基地可提升资源产量，但会失去采集功能。矿点等级不影响采集速度，只增加储量和对接产量。
战术执行层面需掌握计划圈的高级应用。计划圈不仅是行动范围标记，更是战术调度的枢纽。舰队到达计划圈后可激活曲率航行，大幅提升后续部队移动速度。封锁任务能自动刷野怪获取经验，但需注意3级封锁出8级野怪，4级出9级的难度梯度。攻击设置中的自动撤回功能会沿用上次配置，执行连续作战时需特别注意。中立1级据点适合反复刷取经验，击败守卫舰队后及时撤退可重复挑战。多玩家共享矿区能提升资源安全，建议3人协作应对抢矿行为。
